一年生草本。茎直立，高30-120厘米，多在上部分枝，有时自茎基部亦有分枝，但密植则不分枝，基部木质化，无毛，韧皮部纤维强韧弹性，构造如棉。叶互生；叶片线形，线状披针形或披针形，长2-4厘米，宽1-5毫米，先端锐尖，基部渐狭，无柄，内卷，有3（5）出脉。花单生于枝顶或枝的上部叶腋，组成疏散的聚伞花序；花直径15-20毫米；花梗长1-3厘米，直立；萼片5，卵形或卵状披针形，长约5-8毫米，先端凸尖或长尖，有3（5）脉；中央一脉明显凸起，边缘膜质，无腺点，全缘，有时上部有锯齿，宿存；花瓣5，倒卵形，长8-12毫米，蓝色或紫蓝色，稀白色或红色，先端啮蚀状；雄蕊5枚，花丝基部合生；退化雄蕊5枚，钻状；子房5室，花柱5枚，分离，柱头比花柱微粗，细线状或棒状，长于或几等于雄蕊。蒴果球形，干后棕黄色，直径6-9毫米，顶端微尖，室间开裂成5瓣；种子10粒，长圆形，扁平，长3.5-4毫米，棕褐色。花期6-8月，果期7-10月。

亚麻的种子扁卵形，表面多红棕色或灰褐色、棕褐色，少数金黄色和白色，表面平滑而有光泽，种子前端形如鸟嘴而弯曲，一端钝圆，另一端尖而歪向一侧，种子长度4-5毫米，宽2-2.7毫米，种子由角质层、表皮层、薄壁细胞层、石细胞层、第二薄壁细胞层和色素层组成。。放大镜下可见微小的凹点；种脐位于尖端凹入部分，种嵴浅棕色，位于一侧边缘。种皮薄，除去种皮后可见棕色薄膜状的胚乳，内有子叶2片，黄白色，富油性，胚根朝向种子的尖端。气无，嚼之有豆腥味。种子的表皮参内含有果胶物质，当种子遇水时变粘。石细胞层保持种皮硬度，而第二薄壁细胞层和色素层使种子具有色泽。种皮面为蛋白质或胚乳层，胚生长时用他做养料。种子中部为胚由两片子叶及短的胚根组成。以饱满、色红棕、光亮者为佳。

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